一般孕期亲子鉴定有三种办法，分别是羊水亲子鉴定，绒毛亲子鉴定，无创胎儿亲子鉴定。
方法1、无创胎儿亲子鉴定：孕妇怀孕满5周-产前
孕期亲子鉴定选择最多的就是无创胎儿亲子鉴定，也叫静脉血亲子鉴定。这种孕期亲子鉴定方法主要是通过抽取孕妇的静脉血从中提取出胎儿游离的DNA与疑父进行比对鉴定。这种方法孕妇不会产生疼痛感同时也不会对胎儿造成任何的伤害。
方法2、绒毛亲子鉴定：孕妇怀孕11周-13周左右
这种孕期亲子鉴定方法需要通过阴道穿刺到达胚胎绒毛膜的表面进而采集绒毛，此方法具有一定的创伤且会感觉到疼痛，但是准确率很高。因此也有不少的孕妇会选择这种方法做孕期亲子鉴定。
方法3、羊水亲子鉴定：孕妇怀孕14周-21周左右
通过利用子宫羊水也可以进行孕期亲子鉴定，但是这种方法需要配合B超进行同时也配合穿刺手术抽取一定量的子宫羊水进行检测。此方法也会有手术与感染的风险，但仍然是许多进行孕期亲子鉴定孕妇会选择的一种方法。
孕期亲子鉴定共有三种方法可以进行鉴定，每一种应用周数，采样方法都会有差别。孕妇在选择做孕期亲子鉴定的时候要根据怀孕的周数选择合适的方法，大龄产妇，身体较差的孕妇建议选择无创胎儿亲子鉴定。
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